Análisis metagenómico de la abundancia y persistencia de bacterias y microalgas probióticas inoculadas en un cultivo RAS-BIOFLOC a baja salinidad, en agua e intestino de Litopenaeus vannamei

Abstract

La intensificación del cultivo de Litopenaeus vannamei es posible integrando sistemas de recirculación de agua (RAS) con biofloc para mejorar la calidad del agua y aportar valor nutricional. Sin embargo, la proliferación aleatoria de microorganismos no garantiza resultados reproducibles. Este trabajo tuvo como objetivo analizar por metagenómica la abundancia y persistencia de bacterias probióticas y microalgas inoculadas en un cultivo RAS-BIOFLOC a baja salinidad con fases Cría (fC), Levante (fL) y Engorde (fE). El biofloc fue formulado con seis bacterias (Bacillus subtilis, B. subsps. subtilis, B. subsps. inaquosorum, B. cereus, B. cereus ATCC14579 y B. lincheniformis) y diez microalgas (Thalassiosira weissflogii, T. pseudonana, Chaetoceros gracilis, C. calcitrans, Navicula cryptocephala, N. glaciei, N. Perminuta, Ghomphoneis minuta, Isochrysis galbana y Pavlova gryans). Se muestrearon intestinos y agua antes de la siembra de larvas (aS) y al final de cada fase. Las bacterias y microalgas inoculadas persistieron, en agua e intestino durante el cultivo. Los intestinos aS revelaron un 1,5% de las bacterias inoculadas y un predominio de las microalgas C. calcitrans (55,2%), T. weissflogii (15,9%), C. gracilis (13%) y T. pseudonana (10,7%). B. subtilis mostró la abundancia relativa más alta en agua (aS: 6,6%; fL: 11,6%; fE; 14,2%) e intestino (fC 12%; fL; 14,3% y fE; 15,3%) seguida por B. subs. subtilis, (5,8±0,8% y 7,9 ±0,5%) las restantes cepas por debajo del 4%, excepto fC donde predominaron especies nitrificantes Pseudomonas (28,8%). Las microalgas más abundantes en agua fueron G. minuta (41,5±3,1%), N. perminuta (27±2%) y T. weissflogii (11,8±2,9%) y en intestinos N. perminuta (36,1±9,4%), I. galbana (21,4±3,5%), G. minuta (19,3±8,3%) y las restantes especies por debajo del 6%. Los resultados sugieren que las bacterias B. subtilis, B. subsps. Subtilis y las microalgas G. minuta, N. perminuta, T. weissflogii e I. galbana son buenas candidatas para inoculaciones de sistemas RAS-BIOFLOC a baja salinidad.