Caracterización Genomica y proteomica de bacterias costeras nativas degradadoras de hidrocarburos de petroleo

Abstract

Este estudio se llevó a cabo en dos áreas costeras contaminadas con hidrocarburos de petróleo. La microbiota bacteriana de las muestras de suelo contaminado se caracterizó por técnicas independientes de cultivo mediante análisis metagenómico dirigido a ARNr 16S. Además, las bacterias se aislaron e identificaron mediante la secuenciación parcial del ARNr 16S. Las bacterias aisladas que mostraron resistencia al petróleo se caracterizaron por espectrometría de masas MALDI TOF-TOF de shotgun proteómica, considerando en particular las proteínas celulares. La metagenómica de la microbiota bacteriana reveló la presencia de bacterias genéticamente conocidas como degradadoras de hidrocarburos de petróleo como Marinobacter, Halomonas, Pseudomonas, Acinetobacter y Sphingomonas. Se identificaron molecularmente 46 aislamientos bacterianos de ambas áreas contaminadas, siendo los más representativos los géneros: Acinetobacter, Bacillus, Pseudomonas, Halomonas, Stenotrophomonas. La capacidad de las bacterias para degradar los hidrocarburos presentes en el diésel fue evaluada in vitro, siendo Acinetobacter spp. y Serratia marcescens, las cepas más eficientes para la degradación. Finalmente, mediante análisis proteómico se identificó las enzimas alcohol y aldehído deshidrogenasas, monooxigenasa, 2-nitropropano dioxigenasa, que participan en la degradación de los hidrocarburos del petróleo.