Tesishttps://repositorio.untumbes.edu.pe/handle/20.500.12874/1162024-03-29T08:26:20Z2024-03-29T08:26:20ZAplicación de biotecnologías “ómicas” para la caracterización y evaluación de bacterias y microalgas domesticadas de biofloc en cultivo super-intensivo a baja salinidad de Litopenaeus vannamei y con recirculación de aguaLajones Ruano, Gorky Vladimirhttps://repositorio.untumbes.edu.pe/handle/20.500.12874/647212023-12-12T15:08:48Z2023-01-01T00:00:00ZAplicación de biotecnologías “ómicas” para la caracterización y evaluación de bacterias y microalgas domesticadas de biofloc en cultivo super-intensivo a baja salinidad de Litopenaeus vannamei y con recirculación de agua
Lajones Ruano, Gorky Vladimir
El biofloc es un suplemento conformado por microalgas, bacterias y otros
agregados como restos de alimento y heces, los cuales sirven como alimento y
ayudan a mejorar la calidad del agua en el cultivo evitando que compuestos
nitrogenados como Nitrógeno total amoniacal (TAN), nitrito (NO2
-
) y nitrato (NO3
-
)
causen toxicidad a los langostinos. En esta investigación se realizó la adaptación
de bacterias y microalgas obtenidas de cultivo de alta salinidad (33 ‰) para evaluar
su crecimiento en el cultivo super intensivo de baja salinidad (0-5 ‰). Se utilizó la
metagenómica para la caracterización y evaluación de microalgas y bacterias
presentes en el cultivo a baja salinidad de L. vannamei. La evaluación de los
microorganismos se realizó en baldes (P) y en tanques (M) del módulo de cultivo
de langostinos en fase de precría, estadio pl15 con un peso aproximado de 0,0012
g. El análisis metagenómico demostró la presencia de los siguientes géneros
bacterianos en “P”: Cetobacterium 44%, Mycobacterium 12%, Bacillus 12%,
Clostridium 12%, Peptostreptococcus 9%, Methylosinus 6%, Caldilinea 2%,
Rhizobium 2%; y en M estuvieron presentes los géneros Lawsonia 25%, Oscillatoria
22%, Pseudomonas 19 %, Bacillus 14%, Planctomycetes 5%, Rhodobacter 10%,
Brevinema 2%, Hymenobacter 2%, Luteolibacter 1%. A nivel de microalgas se
observó en P: Fottea 24%, Spumella 5%, Rhodomonas 4%, Amphora 2%, entre
otros en menor porcentaje (<1 %); mientras que en M: Cyclotella 20%, Synedra
16%, Desmodesmus 10%, Nitzschia 5%, Scenedesmus 4%, Amphora 3%. Esta
investigación permitió determinar la abundancia de los microorganismos presentes
en el cultivo L. vannamei a baja salinidad. Los resultados obtenidos demuestran
que gracias a los análisis metagenómicos se ha logrado determinar la abundancia
de microorganismos presentes en el agua de cultivo de langostino a baja salinidad.
2023-01-01T00:00:00ZCaracterización molecular de bacterias degradadoras de quitina de pluma de pota (Dosidicus gigas) utilizadas en la producción de metabolitosNavarro Purizaga, Maritza Ylianahttps://repositorio.untumbes.edu.pe/handle/20.500.12874/26502022-03-16T18:03:11Z2022-01-01T00:00:00ZCaracterización molecular de bacterias degradadoras de quitina de pluma de pota (Dosidicus gigas) utilizadas en la producción de metabolitos
Navarro Purizaga, Maritza Yliana
La pluma de pota es un residuo de alto valor por contener β‐quitina en su estructura,
de la cual se puede obtener diversos metabolitos. El objetivo de la presente
investigación fue caracterizar molecularmente bacterias degradadoras de quitina
de pluma de Dosicidus gigas utilizadas en la producción de metabolitos. Se realizó
un análisis de metagenómica a la pluma de pota. Las bacterias fueron obtenidas
del residuo de la pluma de pota y seleccionadas en agar quitina coloidal 1%. La
identificación molecular de las bacterias se realizó mediante PCR del gen 16S
ARNr, y los productos fueron secuenciados e identificados utilizando la base de
datos del BLAST (NCBI) y EzBioCloud. Se identificaron 6 bacterias de las especies
Serratia liquefaciens, Celullomonas flavigena, Stenotrophomonas maltophilia y
Paenibacillus illinoisensis. Se evaluó la eficiencia y el tamaño de halos de hidrolisis
en agar quitina coloidal 1%, siendo C. flavigena la más eficiente y la que presentó
mayor halo de hidrolisis seguida de P. illinoisensis, ambas cepas fueron las únicas
en producir amilasas. S. maltophilia presentó la mejor actividad lipolítica y
amilolítica en comparación con las demás cepas. Mediante PCR end point se
identificó la presencia de los genes chiA, schiA, schiB y schiC, que codifican para
quitinasas. S. liquefaciens presentó el gen ChiA. Los genes schiB y schiC fueron
identificados en S. maltophilia. P. illinoisensis sólo presentó el gen schiC, mientras
que C. flavigena no presentó los genes evaluados. Entre los once tratamientos
considerados en la degradación de la quitina de pluma de pota para la obtención
de metabolitos el tratamiento individual con Paenibacillus illinoisensis (0.156
µmol/min) presentó la máxima actividad quitinasa y producción de quito-oligómeros
a las 24 h de evaluación a un pH 6.20. Los espectros analizados por FTIR
demostraron que la quitina fue parcialmente modificada por la actividad enzimática
de las bacterias seleccionadas.
2022-01-01T00:00:00ZDetección por cultivo, identificación molecular y “Shotgun proteomic” de Perkinsus sp. en Argopecten purpuratus “concha de abanico” (Lamarck, 1819) y Anadara tuberculosa “concha negra” (Sowerby, 1833)Zavala Arellano, Jóselyn Marilynhttps://repositorio.untumbes.edu.pe/handle/20.500.12874/22402021-09-01T04:42:24Z2020-01-01T00:00:00ZDetección por cultivo, identificación molecular y “Shotgun proteomic” de Perkinsus sp. en Argopecten purpuratus “concha de abanico” (Lamarck, 1819) y Anadara tuberculosa “concha negra” (Sowerby, 1833)
Zavala Arellano, Jóselyn Marilyn
Los protozoarios del género Perkinsus sp. son patógenos invasivos, responsables de mortalidades masivas de diversos moluscos bivalvos, y generan grandes pérdidas económicas. Hasta la fecha, los métodos de diagnóstico son limitantes en término de rapidez, sensibilidad y especificidad. El objetivo de este estudio fue detectar e identificar Perkinsus sp. en bivalvos de origen silvestre con importancia económica y social: Argopecten purpuratus y Anadara tuberculosa mediante técnicas alternativas, más sensibles y rápidas. Se colectaron 129 individuos de A. purpuratus y 138 de A. tuberculosa en el transcurso del 2017- 2018. El diagnóstico preliminar de Perkinsus sp. sp fue realizado mediante la observación microscópica de hipnosporas en branquias incubadas en el medio tioglicolato fluído (RFTM), mientras que la identificación taxonómica fue realizada a nivel molecular por PCR. En paralelo se evaluó un nuevo método de diagnóstico basado en la detección de proteínas de Perkinsus sp. mediante “Shotgun proteomic”. La prevalencia de Perkinsus sp. fue 13,95% en A. purpuratus y 21,7% en A. tuberculosa. Los individuos de A. purpuratus mostraron niveles de infección de muy leves a moderados, mientras que fueron únicamente muy leves en A. tuberculosa. Los análisis moleculares basados en la secuenciación del ITS permitieron identificar a P. chesapeaki en A. purpuratus y P. beihaiensis, así como, P. chesapeaki en A. tuberculosa. El diagnóstico por shotgun proteomic concordó al 100% para las muestras de A. purpuratus y al 73.3% para A. tuberculosa con muestras previamente diagnosticadas por RFTM. De estas muestras se identificó 23 fragmentos distintos de péptidos pertenecientes a Perkinsus sp.. El 60.8% de estos péptidos provienen de proteínas codificadas por Perkinsus sp. pero con funciones desconocidas mientras que las demás intervienen en procesos biológicos conocidos. Este trabajo constituye el primer reporte de Perkinsus sp. en moluscos bivalvos en el Perú.
2020-01-01T00:00:00ZAislamiento y caracterización molecular de Schizochytrium sp, (Labyrinthomorpha, Thraustochytridae) del manglar de Tumbes y su evaluación como aditivo alimenticio en la dieta del langostino Litopenaeus vannameiSolano Curay César Agustohttps://repositorio.untumbes.edu.pe/handle/123456789/21782023-01-19T13:30:04Z2016-01-01T00:00:00ZAislamiento y caracterización molecular de Schizochytrium sp, (Labyrinthomorpha, Thraustochytridae) del manglar de Tumbes y su evaluación como aditivo alimenticio en la dieta del langostino Litopenaeus vannamei
Solano Curay César Agusto
Los thraustochytridos son protistas marinos de gran importancia por su producción de biomasa y lípidos ricos en PUFAs omega-3 como DHA importantes en la salud, nutrición y prevención de enfermedades en humanos y animales. En la presente investigación se aisló una cepa de thraustochytrido en un medio modificado para el cultivo de Schizochytrium limacinum. Mediante la microscopía invertida y confocal se observó la viabilidad, pureza, crecimiento de células y contenido lipídico de los thraustochytridos. Se identificó molecularmente mediante el gen del ADNr 18S al organismo Schizochytrium sp. Adicionalmente, por espectrometría de masas MALDI TOF/TOF, se identificaron una sintetasa de ácido graso de tipo 1 y una desaturasa delta-4, enzimas de síntesis de lípidos características de Schizochytrium sp. En los ensayos in vivo se usó 1 % de biomasa de Schizochytrium sp. y 25 % de ensilado de pescado como aditivos en la dieta de larvas de Litopenaeus vannamei, mostrando un incremento significativo de 15 % crecimiento y 20 % supervivencia en comparación al tratamiento control. Esta investigación ha abierto el camino relacionado a la inmunonutrición en langostino utilizando thraustochytridos, ampliando a estos microorganismos las numerosas aplicaciones de las técnicas de proteómica y lipidómica mediante la espectrometría de masa MALDI TOF/TOF.
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